育種学や品種改良技術への応用が可能に! 植物受精卵の半球形状を生む細胞壁変形原理を解明
シロイヌナズナ受精卵の半球状先端成長を再現する粘弾塑性変形モデル
令和6年12月13日
秋田県立大学
P ress Release【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O2-X1JTtJh4】【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O1-3b7wjQA6】
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT1fl_1BW9VbH0.png】
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT2fl_Ys5X15NJ.png】
育種学や品種改良技術への応用が可能に 植物受精卵の半球形状を生む細胞壁変形原理を解明
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT3fl_Hz2cbT5x.png】
■ 概要
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT4fl_3z170S1M.png】
■ 発表のポイント
シロイヌナズナの受精卵先端が半球状態を維持しながら成長する現象を力学モデルで再現しました.
受精卵半球を維持するためには細胞壁進展性がコサイン型分布であることや法線方向に変位する必要があることがわかりました.
顕微鏡で得られる細胞形状から力学モデルおよび成長様式を特徴づけることが可能になり,育種学や品種改良技術への応用が期待されます.
図1:受精卵が半球を維持しながら成長することを発見【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O3-G9CHIxp3】
(A)シロイヌナズナ受精卵のライブイメージングデータ.
(B)細胞先端の楕円近似および曲線座標による定量化の概念図.
(C)受精卵が横半径と縦半径がほぼ等しい半球状であることを確かめた定量結果.
■ 成果掲載誌
本研究成果は,ケンブリッジ大学出版Quantitative Plant Biology誌に,令和6年12月12日午前10:00(グリニッジ標準時,日本時間JST 18:00)に掲載されました.
論文タイトル:A Viscoelastic-plastic Deformation Model of Hemisphere-like Tip Growth in Arabidopsis Zygotes (シロイヌナズナ受精卵の半球状先端成長を再現する粘弾塑性変形モデル)
著者:Zichen Kang, Tomonobu Nonoyama, Yukitaka Ishimoto, Hikari Matsumoto, Sakumi Nakagawa, Minako Ueda, Satoru Tsugawa
DOI:https://doi.org/10.1017/qpb.2024.13
■ 研究の詳細
・研究の背景
植物細胞の成長パターンは2つのタイプに分類でき,細胞表面全体が成長する拡散成長と先端のみ成長する先端成長があります.先端成長様式をもつ器官や細胞の例としては,ヒゲカビなどの菌類やシャジクモ仮根などの藻類器官に加え,被子植物の根毛や花粉管などが挙げられ,これまで多くの細胞で成長部位や成長速度が特定されてきました.著者らの先行研究において,被子植物であるシロイヌナズナの受精卵も先端成長様式であることが明らかにされていましたが,一細胞である受精卵がどのような仕組みで先端成長を達成しているかは詳しくわかっていませんでした.このような生物学的な研究発展がある一方で,数理物理学分野では,細胞壁の変形を考慮した細胞力学モデルが考案されており,実際の細胞成長中の形状,細胞表面の力学,細胞壁変形様式を同時進行的に分析することが可能になっていました.そこで,本研究では,実験データで得られる受精卵形状データと細胞力学モデルを相互参照することで,受精卵がどのような力学的原理を使って先端成長を達成しているかを解き明かすことを目指しました.
・本研究の成果
本研究では,まず顕微鏡画像内の細胞形状データを分析することで,受精卵が半球状態を維持しながら成長することを定量的に確かめました(図1).この結果を元に,細胞力学モデル(図2A)において実際の細胞形状データを再現するパラメータを探索したところ,細胞壁変形分布がコサイン型である必要があることがわかりました.さらに,この実データを再現する細胞力学モデルの成長様式が,細胞表面の法線方向に変位するという特殊な様式であることもわかりました(図2B).このような成長様式を限定することで,受精卵の半径と成長速度の時間平均を用いて,実験データと細胞力学モデルを相互参照する形態空間解析(2)を行い,実データに近い細胞力学モデルを再構築することに成功しました.このように,細胞成長を表現するデータ駆動型細胞力学モデルの再構築は,多種多様な植物細胞の変形画像に応用が可能であり,植物細胞の成長メカニズムを知る強力な分析ツールになると考えられます.
図2:細胞力学モデルの概要とデータ-モデル同化の結果図.
【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O4-H8imhAwb】
(A)受精卵成長を再現する細胞力学モデル.細胞形状にかかる内部膨圧に応じて表面張力が生じ(STEP1,STEP2),その張力が部分的に不可逆的な塑性変形を起こすことで(STEP3),細胞成長が実現するモデルである.
(B)受精卵が成長中に半球を維持するには表面の垂直方向に変位する必要があることを示す結果図.
(C)受精卵の伸長速度および先端半径のデータにデータ同化させた結果図.実際の細胞形状をほぼ再現する力学モデルの構築に成功.
・今後の期待
植物受精卵の成長動態を知るためには,顕微鏡観察が有効ですが,顕微鏡の画像だけでは形状と変形のみしか定量化することができません.本研究のように,細胞力学モデルを実際の細胞形状データに同化させる技術の開発によって,”顕微鏡では見えない”表面力学や細胞壁変形量を定量的に議論することが可能になります.このような植物生理学・画像分析・機械工学の融合研究によって,受精卵細胞の成長メカニズムを特定することができるようになります.このように正確な実験データと細胞力学モデルのシミュレーションを相互参照していけば,今後さらに植物科学による詳細な生物学的知見と機械工学による簡潔な力学的知見が融合し,受精卵や初期胚の形態や成長を研究する育種学や品種改良分野の新しい研究アプローチになることが期待されます.
■ 用語解説
(1)粘弾塑性
材料が弾性(変形すると元に戻ろうとするバネの性質),粘性(変形の速さに応じて抵抗力が働く性質),塑性(不可逆的に変形し元に戻らない性質)を同時に合わせ持つ物質の性質を表す.
(2)形態空間解析
細胞の形態を再現する特徴量(伸長速度,半径,最大曲率など)を用いて,実験データと数理モデルを対応づける解析手法を指す.
■ 研究体制と支援
本研究は,秋田県立大学(康子辰 博士研究員, 野々山朋信 博士研究員, 津川暁 助教),東北大学(植田美那子 教授)との共同研究として行われました.
本研究は,文部科学省の科学研究費補助金(JP19H05670, JP19H05676,JP20K15832, JP22K15135, JP22K21352, JP23H02494, JPMJCR2121),公益財団法人サントリー生命科学財団(SunRiSE)と公益財団法人東レ科学振興会(20-6102)の支援を受けて行われました.
プレスリリース詳細へ https://kyodonewsprwire.jp/release/202412141701
令和6年12月13日
秋田県立大学
P ress Release【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O2-X1JTtJh4】【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O1-3b7wjQA6】
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT1fl_1BW9VbH0.png】
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育種学や品種改良技術への応用が可能に 植物受精卵の半球形状を生む細胞壁変形原理を解明
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT3fl_Hz2cbT5x.png】
■ 概要
【表:https://kyodonewsprwire.jp/prwfile/release/M108422/202412141701/_prw_PT4fl_3z170S1M.png】
■ 発表のポイント
シロイヌナズナの受精卵先端が半球状態を維持しながら成長する現象を力学モデルで再現しました.
受精卵半球を維持するためには細胞壁進展性がコサイン型分布であることや法線方向に変位する必要があることがわかりました.
顕微鏡で得られる細胞形状から力学モデルおよび成長様式を特徴づけることが可能になり,育種学や品種改良技術への応用が期待されます.
図1:受精卵が半球を維持しながら成長することを発見【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O3-G9CHIxp3】
(A)シロイヌナズナ受精卵のライブイメージングデータ.
(B)細胞先端の楕円近似および曲線座標による定量化の概念図.
(C)受精卵が横半径と縦半径がほぼ等しい半球状であることを確かめた定量結果.
■ 成果掲載誌
本研究成果は,ケンブリッジ大学出版Quantitative Plant Biology誌に,令和6年12月12日午前10:00(グリニッジ標準時,日本時間JST 18:00)に掲載されました.
論文タイトル:A Viscoelastic-plastic Deformation Model of Hemisphere-like Tip Growth in Arabidopsis Zygotes (シロイヌナズナ受精卵の半球状先端成長を再現する粘弾塑性変形モデル)
著者:Zichen Kang, Tomonobu Nonoyama, Yukitaka Ishimoto, Hikari Matsumoto, Sakumi Nakagawa, Minako Ueda, Satoru Tsugawa
DOI:https://doi.org/10.1017/qpb.2024.13
■ 研究の詳細
・研究の背景
植物細胞の成長パターンは2つのタイプに分類でき,細胞表面全体が成長する拡散成長と先端のみ成長する先端成長があります.先端成長様式をもつ器官や細胞の例としては,ヒゲカビなどの菌類やシャジクモ仮根などの藻類器官に加え,被子植物の根毛や花粉管などが挙げられ,これまで多くの細胞で成長部位や成長速度が特定されてきました.著者らの先行研究において,被子植物であるシロイヌナズナの受精卵も先端成長様式であることが明らかにされていましたが,一細胞である受精卵がどのような仕組みで先端成長を達成しているかは詳しくわかっていませんでした.このような生物学的な研究発展がある一方で,数理物理学分野では,細胞壁の変形を考慮した細胞力学モデルが考案されており,実際の細胞成長中の形状,細胞表面の力学,細胞壁変形様式を同時進行的に分析することが可能になっていました.そこで,本研究では,実験データで得られる受精卵形状データと細胞力学モデルを相互参照することで,受精卵がどのような力学的原理を使って先端成長を達成しているかを解き明かすことを目指しました.
・本研究の成果
本研究では,まず顕微鏡画像内の細胞形状データを分析することで,受精卵が半球状態を維持しながら成長することを定量的に確かめました(図1).この結果を元に,細胞力学モデル(図2A)において実際の細胞形状データを再現するパラメータを探索したところ,細胞壁変形分布がコサイン型である必要があることがわかりました.さらに,この実データを再現する細胞力学モデルの成長様式が,細胞表面の法線方向に変位するという特殊な様式であることもわかりました(図2B).このような成長様式を限定することで,受精卵の半径と成長速度の時間平均を用いて,実験データと細胞力学モデルを相互参照する形態空間解析(2)を行い,実データに近い細胞力学モデルを再構築することに成功しました.このように,細胞成長を表現するデータ駆動型細胞力学モデルの再構築は,多種多様な植物細胞の変形画像に応用が可能であり,植物細胞の成長メカニズムを知る強力な分析ツールになると考えられます.
図2:細胞力学モデルの概要とデータ-モデル同化の結果図.
【画像:https://kyodonewsprwire.jp/img/202412141701-O4-H8imhAwb】
(A)受精卵成長を再現する細胞力学モデル.細胞形状にかかる内部膨圧に応じて表面張力が生じ(STEP1,STEP2),その張力が部分的に不可逆的な塑性変形を起こすことで(STEP3),細胞成長が実現するモデルである.
(B)受精卵が成長中に半球を維持するには表面の垂直方向に変位する必要があることを示す結果図.
(C)受精卵の伸長速度および先端半径のデータにデータ同化させた結果図.実際の細胞形状をほぼ再現する力学モデルの構築に成功.
・今後の期待
植物受精卵の成長動態を知るためには,顕微鏡観察が有効ですが,顕微鏡の画像だけでは形状と変形のみしか定量化することができません.本研究のように,細胞力学モデルを実際の細胞形状データに同化させる技術の開発によって,”顕微鏡では見えない”表面力学や細胞壁変形量を定量的に議論することが可能になります.このような植物生理学・画像分析・機械工学の融合研究によって,受精卵細胞の成長メカニズムを特定することができるようになります.このように正確な実験データと細胞力学モデルのシミュレーションを相互参照していけば,今後さらに植物科学による詳細な生物学的知見と機械工学による簡潔な力学的知見が融合し,受精卵や初期胚の形態や成長を研究する育種学や品種改良分野の新しい研究アプローチになることが期待されます.
■ 用語解説
(1)粘弾塑性
材料が弾性(変形すると元に戻ろうとするバネの性質),粘性(変形の速さに応じて抵抗力が働く性質),塑性(不可逆的に変形し元に戻らない性質)を同時に合わせ持つ物質の性質を表す.
(2)形態空間解析
細胞の形態を再現する特徴量(伸長速度,半径,最大曲率など)を用いて,実験データと数理モデルを対応づける解析手法を指す.
■ 研究体制と支援
本研究は,秋田県立大学(康子辰 博士研究員, 野々山朋信 博士研究員, 津川暁 助教),東北大学(植田美那子 教授)との共同研究として行われました.
本研究は,文部科学省の科学研究費補助金(JP19H05670, JP19H05676,JP20K15832, JP22K15135, JP22K21352, JP23H02494, JPMJCR2121),公益財団法人サントリー生命科学財団(SunRiSE)と公益財団法人東レ科学振興会(20-6102)の支援を受けて行われました.
プレスリリース詳細へ https://kyodonewsprwire.jp/release/202412141701